一、法律风险

代办工商注册企业往往存在法律风险。由于代办机构的资质和专业能力参差不齐，一些不法机构可能存在违法行为，如虚假材料、非法代办等，给企业带来法律纠纷和经济损失。

二、信任问题

代办工商注册企业可能引发信任问题。由于代办机构与企业之间存在利益关系，一些不良代办机构可能以虚假承诺吸引客户，但实际操作中却无法兑现，导致企业信任受损。

三、服务质量

代办工商注册企业的服务质量参差不齐。一些代办机构缺乏专业知识和经验，无法提供全面、准确的注册服务，可能存在操作不规范、效率低下等问题，给企业带来不必要的麻烦和损失。

四、成本

代办工商注册企业的成本较高。代办机构通常会收取一定的服务费用，而且随着服务的增加，费用也会相应增加。对于创业初期的小微企业来说，这可能增加了财务压力，限制了企业的发展。

五、监管不到位

代办工商注册企业的监管存在不足。由于代办机构众多，监管机构难以对其进行全面监管，一些不法代办机构可能存在违规操作，而企业往往难以获得有效的维权渠道，导致法律保护不到位。

六、信息泄露风险

代办工商注册企业可能存在信息泄露风险。企业在注册过程中需要提供大量敏感信息，如身份证号码、银行账户等，一旦代办机构存在信息安全漏洞，企业的重要信息可能被泄露，给企业带来严重的损失。

七、缺乏自主能力

代办工商注册企业可能导致企业缺乏自主能力。企业委托代办机构进行注册，虽然节省了时间和精力，但也使企业对注册流程和相关法律规定缺乏了解，一旦代办机构出现问题，企业可能无法独立解决，影响企业的长期发展。

代办工商注册企业存在法律风险、信任问题、服务质量、成本等多个方面的缺点。在选择代办机构时，企业应慎重考虑，并尽量选择有资质、信誉良好的机构进行合作，同时加强自身对注册流程和法律规定的了解，以降低风险，确保企业的正常运营和发展。